У другому сезоні аніме "Ласкаво просимо до класу еліти," глядачі знову мають нагоду пірнути у феерію повсякденності одного з найвизначніших навчальних закладів країни - старшої школи Кедо Ікусей. Це навчальне установище відзначається своєю неперевершеною результативністю: сто відсотків випускників, які завершують тут навчання, вступають до університетів або знаходять роботу. Це місце, де нічого не значить зовнішній вигляд учнів, ідеалізується лише навчальний процес. Школа Кедо Ікусей може здатися справжнім райським куточком на землі, і це не перебільшення. Проте створити аналогічний навчальний заклад є практично неможливим завдяки специфіці його функціонування. В цій школі не терплять ледарів та нецілеспрямованих особистостей. Сюди допускають лише найвідповідальніших та цілеспрямованих учнів. Виключати невдах - це звичайна практика, оскільки статистика навчального закладу є дорожчою за будь-яке випадкове спотворення.
Головний герой цього сезону - Кієтака Аянокодзі. Він потрапив у клас D, який відомий тим, що тут навчаються студенти з низькими оцінками. Відсутність уваги під час вступних іспитів призвела до цього. Але виявилося, що Кієтака - це надзвичайно обдарований і розумний студент. З підтримкою двох відданих подруг він вирішує виправити ситуацію та заслужити повагу вчителів. В цьому сезоні аніме розкриваються теми конкуренції, навчання та самореалізації учнів, які мріють стати частиною найкращих. Підтримка та дружба однокласників стають надзвичайно важливими на їхньому шляху до досягнення успіху. Глядачі отримують можливість глибше проникнути у атмосферу навчання та внутрішні переживання героїв, які віддано працюють над тим, щоб отримати визнання в цій престижній школі. Вони стикаються з різноманітними викликами, але разом завдають їм розправи та рушають до досягнення мети.
